Hola Luis1996,
Gracias por escribir en los foros de National Instruments. Recuerda que LabVIEW es un ambiente de programación que se basa en el flujo de datos. Es decir, que los 'bloques' (el código gráfico) se ejecutará conforme las entradas necesarias estén disponibles. Te recomiendo echar un vistazo a un sitio sencillo para dar los primeros pasos en: http://www.learnni.com/
Así pues, notarás que cuando colocas varios ciclos no conectados entre sí, éstos se ejecutarán de modo paralelo en tu programa (el paralelismo real dependerá de la cantidad de procesadores, sistema operativo, etc.). Puedes utilizar variables locales para transferir datos entre ellos (por ejemplo, al detener la aplicación, o la variable de entrada), mas ten cuidado con las condiciones de carrera. Si quisieras mejorar el rendimiento de tu aplicación, te recomendaría también echar un vistazo a la estructura de eventos, de tal suerte que pudieras evitar polear los valores de tu panel frontal:
Espero te sea de utilidad, un saludo!