Désordonner une chaîne

[ProdhonRomaric]

Bonjour, je suis un simple étudiant en Bac+2 et j'ai un petit projet à présenter mais j'ai un problème de taille au démarrage :

Je voudrais générer une chaîne de x caractères comprenant uniquement les caractères A, T, C, G. Jusque là, rien de bien compliqué, je me suis dit A=0 T=1 C=2 G=3 et je les génère par le hasard.

Là, ou ça se corse, je voudrais avoir un certain pourcentage de C et G par rapport au total des caractères et là je suis bloqué.

Admettons que je veule 60% de caractères C et G dans ma chaîne de longueur 20 par exemple. J'ai eu l'idée de générer une chaîne de 0.6*20=12 caractères pour les C et G et du coup 8 pour les A et T et de les concaténer et voilà le problème, j'obtiens :

CGGGCGCGCCGGAATTTATA

Je voudrais que ces caractères soient complètement mélangés ( ex : CCATGCGAGACTAGGGTTCG ) pour la suite de mon programme.

Comment faire intervenir le désordre avec cette chaine ?

Et là, je sèche, j'ajoute que je débute en Labview et que mon prof n'a pas su me répondre non plus, je m'en remets donc à vous 😕

Merci d'avance à ceux qui répondront !

[altenbach]

Try this.

[MaximeR]

Bonjour CapitaineNemo,

Voilà une solution qui génère une chaîne de caractère à la taille souhaitée et qui contient une proportion paramétrable de C et G.

Dans mon VI, je suis parti du principe qu'on voulait autant de A que de T et autant de C que de G mais qu'on peut choisir la proportion de C+G par rapport à A+T. Lors des divisions pour calculer les nombre de lettres, j'ai priviliégier le A et le C en faisant la division entière et en ajoutant le reste au A et au C.

 

Ensuite on vient mélanger le tableau généré avec la fonction donné par @altenbach.

Je te laisse nous dire si ca te convient.

Si c'est bon pour toi, pense à marquer ta question comme résolue et a remercier les contributeurs.

[ouadji]

@MaximeR : "... proportion paramétrable de C et G"

comprends pas ...  Pourquoi "proportion" ?

Perso, il me semblait avoir compris qu'il fallait simplement "mélanger"  ...

donc reprendre la totalité de l'entrée et simplement y inclure un ordre aléatoire.

EDIT

au temps pour moi, je dois encore avoir le cerveau dans la colle.

J'ai relu ... ok Maxime ... tu as raison.

[R3g]

Salut,

Ci-dessous l'exemple de MaximeR modifié, à la place de la boucle For j'utilise les valeurs décimales des caractères ATCG:

A+