Buen día!!
Si es posible utilizar dos dispositivos en la misma computadora para la misma aplicación, únicamente debes utilizar el alias que se le asigna en MAX (por ejemplo ''Dev 1'') para crear la tarea (DAQmx Task) de cada dispositivo en la aplicación. De esta manera, cada dispositivo tendrá su propia tarea de adquisición que podrás iniciar y detener de manera individual.
Dependiendo de la arquitectura de tu aplicación, puedes hacer que ambas tareas de adquisición para los sensores de humedad y temperatura se realicen de manera síncrona o asíncrona. Te dejo el siguiente link, donde viene un ejemplo para sincronizar la adquisición de canales analógicos en dos dispositivos diferentes (Multi-Device Synchronization):
http://zone.ni.com/devzone/cda/tut/p/id/6829
Espero que te sirva!!
Saludos,
Anuar Rojas
Anuar R.
National Instruments México y Latinoamérica
Ingeniería de Aplicaciones
www.ni.com/soporte