Hola RicMBM
El USB 6003 es un dispositivo DAQ que trabaja a través del Driver DAQmx que fue creado para Windows y algunos otros. EL myRIO es un dispositivo que tiene un sistema operativo Real-Time y que trabaja mediante programación en FPGA por lo que el paradigma de ambos dispositivos es diferente.
Si puede que exista alguna manera de comunicación ya sea por comunicación serial, no tendrías acceso a las funciones de DAQmx para utilizar el USB-6003.
Adjunto a continuación un documento donde habla de cómo instalar el DAQmx en sistemas RT, pero aquí mismo se aclara que esto solo es posible en PCs y PXIs con RT y no en sistemas RIO debido a su FPGA.
Deploying DAQmx to a Real Time Controller or PC
http://digital.ni.com/public.nsf/allkb/79CB44F7E228AED88625756E00445151
