Catalina,
Puedes comunicarte a los varios dispositivos CAN de PXI por medio de RSTI Bus, en las tarjetas PXI las conecciones estan hechas automaticamente en el PXI Trigger Bus en el J2 Blackpane. Aqui hay unos enlaces que te pueden ayudar.
http://digital.ni.com/public.nsf/websearch/DB41B3005A00781086256BF4004FC7C5?OpenDocument
http://digital.ni.com/public.nsf/websearch/625AF6B3B2A7B63686256F54006F205A?OpenDocument
Si me pueden proporcionar mas información sobre tu aplicacion, modelos de las tarjetas, drvier que estas utilizando, sistema operativo, te puedo dar mas informacion.
Tania Lozoya
National Instruments